怀疑肠炎时通常需进行粪便常规、血常规、肠镜检查、影像学检查和病原学检测等检查。肠炎可能由感染、免疫异常、饮食刺激等因素引起，需结合检查结果明确病因。
粪便常规是肠炎的基础筛查项目，通过观察粪便颜色、性状及显微镜下检测红细胞、白细胞、寄生虫卵等，可初步判断是否存在肠道炎症或感染。细菌性肠炎患者粪便中常见脓细胞和吞噬细胞，阿米巴肠炎可能检出溶组织内阿米巴滋养体。该检查无须特殊准备，但需留取新鲜粪便样本送检。
血常规可评估全身炎症反应程度，细菌感染时中性粒细胞比例常升高，病毒感染可能表现为淋巴细胞增多。慢性肠炎患者可能出现贫血或血小板异常。检查需空腹采静脉血，若结果提示严重感染还需结合C反应蛋白、血沉等进一步评估。
结肠镜能直观观察结直肠黏膜病变，溃疡性结肠炎可见连续性糜烂和浅溃疡，克罗恩病多呈节段性纵行溃疡。检查前需清洁肠道，术中可同时取活检进行病理诊断。无痛肠镜需麻醉评估，严重心肺疾病患者慎用。
腹部CT或MRI能显示肠壁增厚、脓肿等深层病变，适用于肠镜无法到达的小肠部位评估。CT小肠造影需口服造影剂，可发现克罗恩病的跳跃性病变。超声检查对肠套叠、肠梗阻等急症有较高诊断价值，且无辐射风险。
粪便培养可鉴定沙门菌、志贺菌等致病菌，病毒性肠炎需通过PCR检测诺如病毒、轮状病毒等核酸。艰难梭菌感染需检测毒素基因。寄生虫感染需采用饱和盐水浮聚法或改良抗酸染色法。部分特殊病原体检测需送疾控中心完成。
疑似肠炎患者检查期间应保持清淡饮食，避免辛辣刺激食物加重肠道负担。急性腹泻需注意补液以防脱水，慢性患者建议记录排便日记辅助诊断。若出现持续发热、血便或剧烈腹痛，应立即就医。所有检查结果需由专科医生综合解读，避免自行用药延误病情。
