肠镜检查通常不会产生明显疼痛，但可能引起轻度不适或腹胀感。肠镜分为普通肠镜和无痛肠镜两种类型，无痛肠镜在静脉麻醉下进行可完全避免不适。
普通肠镜检查过程中，受检者主要会感受到肠腔充气带来的腹胀或牵拉感，尤其在肠镜通过结肠弯曲部位时可能出现短暂痉挛性疼痛。这种不适感多数可以耐受，医生会通过调整进镜速度和注气量来减轻反应。检查前服用解痉药物有助于缓解肠道痉挛，配合医生指令做深呼吸也能有效分散注意力。
无痛肠镜采用静脉注射丙泊酚等短效麻醉剂，使受检者在睡眠状态下完成检查，全程无意识、无痛感。该方式特别适合对疼痛敏感、既往检查耐受性差或存在肛肠疾病的患者。但麻醉需要专业麻醉医师监护，检查后需观察1-2小时直至完全清醒，且当日禁止驾驶和高空作业。
建议检查前3天开始低渣饮食，前1天服用肠道清洁剂排空粪便。检查后2小时内禁食，之后从流质饮食逐渐过渡到正常饮食。若出现持续腹痛、便血或发热需及时就医。定期肠镜检查是结直肠癌筛查的重要手段，40岁以上人群建议每5-10年检查一次。
